安徽中医学院针灸骨伤临床学院，原名针灸系，始建于1986年（1983年针灸专业业已招生），随着专业学科的发展，1997年更名为临床医学二系。2002年为适应改革发展的需要，临床医学二系与针灸经络研究所实现“系所合一”，两块牌子一个机构。2004年10月经学院批准更名为针灸骨伤临床学院。
我院针灸推拿学科是安徽省省级重点学科，也是国家中医药管理局重点学科协作建设单位。现有针灸推拿硕士学位授予点，并与
广州中医药大学联合培养针灸推拿博士研究生，承担着培养高级复合型中医针灸推拿、骨伤、康复人才的任务。近二十年来依靠学校的支持和全体教职员工的勤奋努力，在教学、科研、医疗和对外交流诸方面成绩斐然。
现有针灸推拿学、针灸推拿学（涉外方向）、中医学骨伤方向、中西医临床学（医疗保险方向）、康复治疗学五个本科专业，一个推拿学专科专业。设有针推基础教研室、针推临床教研室、针推文献教研室、骨伤基础教研室、实验教学中心教研室、康复医学教研室、医疗保险教研室等7个教研室。
针灸经络研究所建有经脉脏腑相关、针刺研究、灸法研究等3个研究室。自1979年就设有一个中西医结合基础硕士学位授予点。历年来先后承担了国家和部省级等中标或下达的研究课题近70项，获得国家或部省级奖励12项。国内外发表学术论文550余篇。
我院师资力量雄厚，拥有专、兼职教师、科研人员共４０余人。其中正高职称12人、副高职称13人、博士3人、在职博士1人、省高校拔尖人才1人，一批年轻的博士和硕士新秀正在崛起。目前全系教师中80%为中青年教师，业已形成一支业务水平较高、知识结构合理的高素质师资队伍。目前承担了包括国家科技部重大基础项目、国家自然科学基金项目、973子项目等在内的科研课题达10余项，获省部级、厅局级奖励多项，在国内外学术期刊上发表论文数百篇，出版专著40余部。还承担了全国性、区域性教材的编写工作。针灸骨伤临床学院大部分教师长年在中医学院门诊部、第一和第二附属医院参加临床工作，并以此为基地指导学生进行医疗实践。许多教师具有丰富的临床教学经验和高尚的医德，成为学生学习的楷模。
目前，针灸骨伤临床学院已培养针灸、骨伤、推拿本专科毕业生1500余人，他们普遍受到用人单位欢迎和重用，毕业生就业率每年保持在90%以上，在校学生人数1500人左右。近年来，为了更好地适应二十一世纪知识经济时代的发展需要，培养综合素质较高的复合型人才，在系统掌握中医基础理论和基本技能的基础上，开展了全面的教学改革，对课程设置及教学体系进行了一系列大胆构想与实践，现已初步形成了一定的教学优势和特色。如：重视专业外语教学，培养学生实际运用英语语言的能力，使其毕业后能较娴熟地应用外语进行国内外学术交流；鼓励教师进行授课方法的创新，倡导多媒体教学，浓缩授课时数，注重学生动手能力的培养，除设置必要核心专业课程外，还根据不同的培养方向设立“拓展模块”，使学生学习目标明确，更积极主动地学习；我院还请部分高职称教授兼任学生的修身导师，不但“教书”，更重“育人”。在今后的工作中，我院将以教学工作为根本，以科研工作为重点，以临床基地建设和国际交流为手段，实现全方位发展目标，将我院建设成为全国有影响的教学、科研、临床基地。
针灸骨伤临床学院还承担着各种短期外国进修生的针灸专业课教学。二十年来已有数十个国家和地区的近百名学生来我院学习了针灸，为弘扬中医学术，把针灸推拿学推向世界，促进我国和世界各国的交流做出宝贵贡献。我院教授应邀到韩国、美国、萨摩亚、法国、南斯拉夫及新加坡等国开展教学和学术交流，在当地均受到赞誉，留下良好印象。我院正日益成为对外交流的重要窗口。
