一九六五年，「壽山佛學院」於佛光山壽山寺創建，是佛光山僧伽教育的起點。當時星雲大師為造就佛教專才，以從事佛教教育、文化、慈善等事業，達到人心之淨化，社會之安和樂利為宗旨，改革了當時佛教教育的諸多弊病，如：缺乏教學計畫、教材，及學生思想不夠開展等，而讓台灣的佛教教育制度開始健全。
三年辦學，校地漸不敷使用。民國五十六年十月，另闢新校舍於今佛光山寺，並將佛學院院名更為「東方佛教學院」。累積歷年的經營與發展經驗，配合時代脈動的需要，與學生的個別差異、學習性向，佛光山僧伽教育於民國七十八年間著手進行佛教教育學制的改革，建立三級層次的佛教教育制度。第一級「中國佛教院研究院」旨在培養佛教師資及高深的佛學研究人才；第二級「佛光山叢林學院」屬於大學級教育，旨在培養佛教文化、教育、慈善、弘法等專業人才；第三級「東方佛教學院」，屬於初中至高中程度，旨在培養青少年學佛，以培養高尚品格，端正身心。其中，「佛光山叢林學院」更曾經廣分為國際學部和專修學部，共十五個學部遍及海內外，分別是佛光山英文佛學院、佛光山日文佛學院、佛光山男眾佛學院、佛光山女眾佛學院、基隆女子佛學院、彰化福山佛學院、美國西來佛學院、澳洲南天佛學院、非洲佛學院、馬來西亞東禪佛學院、香港佛教學院、印度佛學院、佛光山外籍學生研修班、佛光山沙彌學園、佛光山屏東學園，讓佛法傳承無國界限制，逐步達成有人的地方就有佛法的理想。也在佛法的傳遞上，豎窮三際，橫遍十方，既深又廣的讓佛法久住世間。
民國九十七年，為因應時代的脈動及青年佛子的需求，叢林學院在創辦人星雲大師的領導下，創時代改革佛學教育，在傳統修道生活中，添加現代化的思考，將學制分成弘法行政、寺務管理及佛教應用學三系，期望能真正因材施教，不但為佛教培養專業人才，以達佛法久住之本意，更希望能為青少年學子打造一個快樂的學習環境，讓個人發揮所長，藉由佛法，尋找自我人生的定位與價值。
由於佛光山愈四十來不遺餘力的推行人間佛教，目前在社會中的地位大受肯定，前來佛學院問道求法者的層次日漸提高，其中不乏在各機關行號任職主管之人士，他們寧願放下高薪名位，接受甘露法水的洗禮。此外，學生的教育程度亦有提昇之趨勢，目前的學生中擁有大專以上學歷者達百分之三十。學佛者素質的提高，使得佛教的前途呈現一片燦爛的遠景。
另外，就完成學習的學生來說，自早期的壽山佛學院創辦至今，歷屆畢業生之成績斐然，所完成出版的著作廣受大眾所傳頌者計有七十餘種，其它散見各報章雜誌文章更是不計其數，近幾年來在學術會議中所發表的論文不計其數，繼續鑽研深造者分佈世界各國，計有榮獲博士學位或正進修博士班者有十八人，榮獲碩士學位或在進修碩士班者有一百二十五人。此外在海內外道場中住持一方、弘法利生、從事佛教各種事業者濟濟一方。
