我院建于1960年,是全国第二批成立的高等中医药本科院校，硕士学位授权单位。经过49年的建设，我院现已发展成为以本科教育为主，开展研究生教育和对外教育的高等中医药院校,为云南省培养出各类型、各种层次的中医药专门人才2.2万余人。
2007年12月，教育部对我院进行了本科教学工作水平评估，最终结果为“优秀”。
我院历时三年建成的呈贡新校区一期工程，已于2008年9月1日建成并投入使用。2009年3月1日，我院院本部全日制本专科生、研究生和留学生3000余人及教职员工近600人入驻呈贡新校区，实现了我院院本部整体成建制地入驻呈贡校区办学，是我省昆明地区第一所整体入驻呈贡办学的高校。
目前，我院有白塔、关上、呈贡三个校区，总面积851.78亩，建筑面积共计25.84万平方米。呈贡校区为学院院本部。
在呈贡校区的建设中，我们选取“秦砖汉瓦、汉唐风格、博士帽檐、天圆地方”的特征作为建筑设计元素，采用“柔、透、秀”的建筑手法，通过“连廊、楼、亭、榭、景”衔接联系各建筑单体，建成各具特色、相互呼应、整体协同的建筑群。
在校园布局和文化特征上，正大门的五行五色大地广场与科技信息大楼内的阴阳太极图处于学院大门中轴线，象征着中医药传统文化及理论核心阴阳五行学说是学校学术发展的主体及历史传承；在校园人工湖中，建设了湖中
葫芦岛，寓意“悬壶济世，大医精诚”的中医药学家的医德、医风、医业之精髓。
整个校园力求中国传统文化与中医药科学内涵相融合，继承传统与发展创新相统一，立足现代与面向未来相统一，建筑风格与人文精神相统一，办学功能与育人环境相统一。
我院始终坚持以中医药学科为主体，发掘和建设民族医药特色学科，支持学科间的融合与渗透，积极发展相关学科；现有涵盖医学、理学、工学、管理学等4个学科门类的本科专业15个。其中，中医学为国家特色专业。中医学、中药学、制药工程、针灸推拿学和中西医临床医学为省级重点专业。我院1986年获硕士学位授予权。现有一级学科中医学、中药学、中西医结合硕士学位授权点3个，二级学科硕士学位授权点16个。设有中药学院、基础医学院、临床医学院、社科部、公共课程部、研究生部、成人教育学院等7个教学机构。
目前，我院有各类别各层次在校学生7000余人。其中：在校日校本专科生3467人；硕士研究生283人；成人高等学历教育学生3300余人；留学生（含港澳生）和短期留学生近200人。
目前，全院现有在职教职工1276人。其中：院本部591人，正高级职称34人，副高级职称111人；第一附属医院685人，正高级职称20人，副高级职称99人。
我院共有国务院突出贡献专家1人，享受国务院政府特殊津贴专家10人；全国名老中医师带徒指导老师13人；国家教育部医药学类教学指导委员会委员2人；省级有突出贡献专家4 人，享受省人民政府特殊津贴专家4人；云南省名中医、荣誉名中医35人；云南省教学名师2人；云南省中青年学术技术带头人1人、后备人才1人；博士后生导师、博士生导师1人，硕士生导师145人。
我院图书馆纸质藏书48万余册；有15个实验室（分设23个专门性教学实验室），11个科研机构，2个生药标本馆——“滇南本草馆”和“神农本草馆”，1个民族医药展示室。中医药学分子生物学重点实验室和云南民族药现代研究重点实验室为云南省高校重点实验室建设项目，临床技能综合模拟实验中心为云南省实验教学示范中心。
2000年以来，我院承担科研项目302项。其中，国家级项目13项，省部级项目43项；获得省部级以上等成果奖22项。《云南中医学院学报》是中国科技核心期刊, 荣获首届中国高校科技期刊特色奖，在全国高校优秀科技期刊评比中荣获优秀编辑出版质量奖。2005年，我院主办了首届傣医药国际学术会议。2006年，我院承办了主题为“21世纪天然药研究新思路”的中国科协第131次青年科学家论坛。2008年，我院主办了主题为“加强研究生教育交流与合作、深化研究生教育创新”的第四届“泛珠三角区域（9+2）高等中医药院校合作发展联席会”。2008年11月，主办了主题为“加强研究生教育交流与合作、深化研究生教育创新”的第四届“泛珠三角区域（9+2）高等中医药院校合作发展联席会”。2008年12月，我院受邀加入由美国耶鲁大学郑永齐教授领衔的中药全球化联盟。
我院具有接收外国留学生学历教育资格和港澳台学生学历教育资格，是我省第一家在境外开展专业教育的高校。招收美国、澳大利亚、日本、泰国、越南等10余个国家和港澳台地区学生。与西班牙、澳大利亚、泰国、越南等国家和地区的25所大学、医疗和科研机构建立了合作关系，开展教学、医疗和科研的交流与合作。
我院将继续秉承“崇德和合、博学敦行”的校训，凝全院之心，聚全院之智，举全院之力，统一思想，齐心协力，以“立足边疆，面向基层，培养适应多民族地区需要的中医药人才”为办学特色，全面建设开放文明和谐校园；以优良的校园文化为载体，形成热爱中医中药，热爱学校，尊师爱生，奋发向上的良好校风，不断提高人才培养质量，为保障边疆各族人民的生命健康，为建设富裕民主文明开放和谐的民族文化强省做出应有的贡献。
