宁夏医学院创建于1958年。1962年，学校与宁夏师范学院、宁夏农学院合并成立宁夏大学，改称宁夏大学医学系。1972年，
上海铁道医学院搬迁至
银川，与宁夏大学医学系合并，重建宁夏医学院。2002年，宁夏卫生学校、宁夏护士学校并入宁夏医学院。
目前，学校生源已经覆盖全国25个省（自治区、直辖市），现有全日制在校学生6039人，其中研究生545人（占在校生总数的7.7%）、本科生3570人（留学生95人）。学校固定资产总值8.28亿元，校园占地面积64.79万㎡。2005年，占地1000多亩的新校区建设破土动工，一期13万平方米的项目建设已全部完成，二期项目也已陆续开工。新校区于2007年9月正式投入使用，2008年3月完成全部搬迁任务。
学校实行校、院两级管理体制，设有16个党政管理（服务）部门，7个二级学院（基础学院、临床学院、中医学院、公共卫生学院、护理学院、高职学院、成人教育学院），5个系部（人文社科部、中专部、口腔系、药学与医学检验系、研究生部），以及3个教学辅助部门（现代教育技术中心、图书馆、医学科学技术研究中心）。
现有专任教师628人，其中教授118人，副教授234人，其他高级职称人员64人。具有研究生学位的教师有316人，占专任教师的比例为50.32%，其中博士54人，占专任教师的8.6%。学校高度重视学科带头人、优秀青年骨干教师的培养和选拔以及教师队伍的梯队建设，教师中享受国务院政府特殊津贴的有35人，享受自治区政府特殊津贴人员5人，入选国家百千万人才三层次人选6人，卫生部有突出贡献中青年专家2人，自治区“313”人才22人。学校选拔了59名学科带头人、58名优秀青年骨干教师，形成了老、中、青结合，有发展后劲的骨干教师梯队。
学校可授予医学、管理学、理学三大学科门类的学士学位，共有25个专业及专业方向，已形成了以医学学科专业为主、中西医并存、多学科协调发展的具有地方特色的学科专业体系。拥有研究生、本科和高职3个办学层次，毕业生就业率居宁夏高校前列。
学校现有自治区重点课程5门；自治区级精品课程16门，人体解剖学已申报国家级精品课程；5个自治区实验教学示范中心，基础医学实验中心已申报国家级实验教学示范中心。
学校科研成绩逐年提高，科研水平稳步提升。近五年，各级各类科研项目立项数900项；获省（部）级科技进步奖共62项（其中一等奖2项）；主/参编著作80部。学校注意统筹科技资源，合理优化布局，狠抓重点学科和重点实验室等科技平台建设。目前，已有9个重点学科，其中国家部委级1个，自治区级8个。现有生殖与遗传、颅脑疾病2个自治区级重点实验室。学校在脊柱结核、包虫病研究以及生殖遗传、颅脑疾患的研究方面成绩显著。学校开展了回族医学教育，成立了回族医学研究所，努力使回族医学教育和研究成为办学特色之一。
学校于1978年开始开展研究生教育，是宁夏高校中最早的。目前，拥有1个一级学科（临床医学）、28个二级学科硕士学位授权点，已有27届毕业生。在读研究生545人，累计招收硕士研究生829人。
学校现有直属附属医院1所，编制床位1400张；非直属附属医院4所，编制床位2104张；教学医院5所；实习和见习基地57所。直属附属医院是集医疗、教学、科研和自治区领导干部保健基地等多种职能的一所综合性三级甲等医院，年门诊60万余人次、收治3万余人、完成手术1.6万余例，业务水平较高，对内蒙、甘肃、陕西等毗邻地区具有强大的辐射影响力。1995年医院跻身全国500家大型医院之列。
学校十分重视校际交流与协作，先后与美国夏威夷大学、日本岛根大学、山形大学、加拿大爱尔波特卫生研究所、澳大利亚国立大学医学院、堪培拉大学和首都医科大学、上海交大医学院、山东大学、内蒙医学院等20余所国内外医学院校确立了友好合作关系。
经过近半个世纪的发展，学校在学科专业建设、基础设施、师资力量、教学和科研水平等方面均有了很大的进步和发展。2006年教育部本科教学工作水平评估后，专家组认为：“学校实现了质的飞跃，取得了巨大的突破，发生了天翻地覆的变化。学校已成为了一所规模、结构、质量、效益协调发展，在全国同类院校中有一定影响力和知名度的高等医学院校。”
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